タグは思い出す（検索する）ときのキーワードとして、名詞を付けるのが基本です。関連する人の名前や会社名、ワインなら品種、生産地といったものです。また、「画期的」「いい話」といったような自分の印象をタグにしておいてもいいでしょう。タグを考えるコツは、このノートをGoogleで検索するとしたら、どのようなキーワードを使うかな？と考えてみることです。

タグの一覧で、タグを別のタグの上にドラッグすると、ドラッグした先のタグの下層に移動します。下層タグを含んだタグをドラッグした場合は、下層タグごと移動します。また、［タグ］にドラッグすると最上位のタグになります（Mac版ソフトではタグを右クリックして［ルートレベルにタグを移動する］をクリックすることで最上位にできます）。

例えば「動物」というタグの下に「哺乳類」「魚類」タグがあるとき、「動物」タグを検索しても、「哺乳類」タグがついたノートは見つかりません。つまり、スタックとノートブックの関係と違って、上層タグが下層タグをまとめて含むわけではなく、上層タグを検索しても下層タグは見つかりません。階層化タグは、よく一緒に使うタグをまとめておくための機能だと考えましょう。例えばワインが好きなら「ワイン」タグの下層に「白ワイン」「赤ワイン」そして「フランス」「イタリア」といった、切り口の違うタグをまとめておくこともできます。そして「フランスの赤ワイン」のノートを取り出したい場合には、「フランス」と「赤ワイン」のタグを［Ctrl］キーを押しながらクリックすれば、すぐに絞り込むことができます。

タグの一覧を見やすくするためのコツは３つあります。1つ目は不要なタグをこまめに削除することです。［表示］-［割り当てのないタグを表示］のチェックをはずすと、一覧表示中のノートで使われているタグだけを表示するようにできます。2つ目は、「机」と「テーブル」のように似た意味のタグをまとめ、タグを付けるときに迷わないようにすることです。3つ目は反対に、「音楽」のような意味の広いタグの下層に「ロック」「クラシック」のように細分化したタグを作り、分かりやすくすることです。なお、特に重要なタグは「@赤ワイン」のように頭に記号を付けると、一覧の上に表示され見つけやすくなります。これもちょっとしたコツです。